Pavel Otoupal po určitých problémech jím nezaviněných  ukončil v r. 1961 VŠV v Brně a v r. 1968 obhájil kandidátskou práci a byl mu udělen titul CSc. Svá studia si doplnil na LFH v Praze a pak nastoupil v r. 1976 do Vojenského ústavu hygieny, epidemiologie a mikrobiologie v ÚVN v Praze, kde působil až odchodu do důchodu. Ve své práci se zaměřil na zdravotně nutriční stav vojáků a na otázky výživy a hygieny ve stravovacích zařízeních vojenských útvarů. Kromě toho přednášel na několika vysokých školách. V posledních létech se věnuje zejména systému HACCP.

Dr. Otoupal je členem SPV od r. 1976 a pracuje v redakční radě Zpravodaje školního stravování, který je součástí časopisu Výživa a potraviny. Rád publikuje články z oblasti hygieny výživy a školního stravování. V posledních létech byl předsedou revizní komise SPV.